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Research News & Publications — GqLiu Lab
6月15日，第十五届“挑战杯”内蒙古自治区大学生创业计划竞赛决赛在巴彦淖尔市的河套学院圆满落幕。本届赛事覆盖面广、含金量高，决赛汇聚全区各高校292个优质创业科创项目同台竞技，经过多轮严苛考核，我院2024级研究生参赛项目“寻根溯源——基于低重组区微单倍型的亲缘鉴定利器”，凭借独特的技术创新、扎实的科研成果和出色的现场答辩表现，从数百个参赛项目中脱颖而出，斩获生物医药与健康科技赛道研究生组自治区特等奖，充分彰显了我院研究生群体优秀的科研创新能力与创新创业素养。
研究整合化学剪切法高精度核小体定位图谱与 Nanopore 直接 RNA 测序数据，在裂殖酵母中系统揭示了核小体定位调控 RNA 剪接的分子机制：高使用频率剪接位点下游呈现强烈核小体相位，该定位模式主要由转录因子而非 DNA 序列本身驱动；RNA 聚合酶在剪接位点处的瞬时停顿为剪接因子识别争取时间；具有内含子的高表达基因还形成增强的中距离染色质接触，为共转录剪接提供亚核环境支持。
研究团队整合1000基因组计划数据与高分辨率重组图谱，首次将减数分裂重组速率纳入微单倍型筛选体系，从低重组区筛选出30个高效微单倍型标记，在亲子鉴定中全面优于高重组区标记，并开发了配套在线数据库与分析工具MHpatools。
本研究基于DNA形变能模型，系统探究核小体旋转定位对先锋转录因子（PTFs）与核小体结合的调控作用。体外分析表明SOX7和P53的结合强烈依赖于其识别基序在核小体上的旋转方位；然而对OCT4、SOX2、KLF4等8种PTFs的体内分析显示，结合与未结合的基序在核小体上总体呈现一致的旋转定位倾向，表明在体内环境下旋转定位并非调控PTFs结合的关键决定因素。这一现象在细胞重编程和胚胎干细胞分化过程中同样存在，揭示了PTFs通过超越旋转定位的机制主导染色质开放的独特能力。